華大基因家蠶超級泛基因組研究成果入選國內(nèi)十大科技新聞

隨著基因科技的不斷發(fā)展,科學家運用先進的基因測序技術開展跨領域泛基因組研究,基因科技助力創(chuàng)新成果層出不窮。

近日,中央廣播電視總臺正式發(fā)布2022年度國內(nèi)、國際十大科技新聞,其中,由西南大學家蠶基因組生物學國家重點實驗室主任、國家蠶桑產(chǎn)業(yè)技術體系首席科學家代方銀教授團隊聯(lián)合華大基因等單位合作完成的家蠶超級泛基因組項目入選2022年度國內(nèi)十大科技新聞。

研究團隊基于華大基因自主研發(fā)的時空組學技術Stereo-seq,對1078份蠶種質(zhì)資源進行了深度短讀長測序,并對其中545份代表性資源進行了長讀長測序,產(chǎn)生55.57T基因組數(shù)據(jù),組裝了545個蠶的高質(zhì)量基因組,對100個基因組進行了基因注釋,鑒定到4,300余萬個SNP、930余萬個Indel、340余萬個結構變異(SV)和7,308個新基因(家族),繪制了一個世界首張千蠶高精度家蠶泛基因組圖譜,助力人類構建泛基因組,賦能未來作物育種。

中國科學家繪制完成世界首張千蠶高精度基因遺傳變異圖譜

近年來,單細胞組學技術的不斷發(fā)展,使得研究團隊從單個細胞中獲得大量的轉(zhuǎn)錄組、表觀遺傳和蛋白質(zhì)組學信息。能夠幫助細胞的基因表達信息和空間信息一一對應的空間組學技術則成為了2022年最值得關注的七大年度技術之一。

華大基因作為基因行業(yè)的奠基者,致力于通過基因檢測、質(zhì)譜檢測、生物信息分析等多組學大數(shù)據(jù)技術手段,為科研機構、企事業(yè)單位、醫(yī)療機構、社會衛(wèi)生組織等提供研究服務和精準醫(yī)學檢測綜合解決方案。2021年初,華大基因重磅發(fā)布其自主研發(fā)的時空組學技術Stereo-seq。該技術通過時空捕獲芯片,結合原位RNA捕獲,實現(xiàn)了500 nm的分辨率,同時捕獲面積可達13cm x 13cm,成為全球首個同時實現(xiàn)“納米級分辨率”和“厘米級全景視場”的技術。

被譽為新時代分子“顯微鏡”的Stereo-seq技術,自發(fā)布以來,為人類重新認知器官結構、生命發(fā)育、物種演化和定義人類疾病提供了底層工具,持續(xù)創(chuàng)造生命科學領域的多項突破性研究。在繪就世界首張千蠶高精度基因遺傳變異圖譜之前,該項技術助力繪就小鼠器官發(fā)生圖譜、斑馬魚胚胎發(fā)生過程中基因表達全景圖譜及發(fā)育軌跡的時空映射、果蠅胚胎和幼蟲發(fā)育的高分辨率3D時空轉(zhuǎn)錄組圖譜等多項泛基因組項目研究。

華大基因助力科研團隊繪就千蠶高精度基因遺傳變異圖譜之外,還率先完成家蠶基因庫數(shù)字化的構建,對于深化功能基因組研究和推動家蠶模式化,開啟家蠶設計育種,賦能“改造家蠶、多元利用”等方向?qū)⑻峁┲匾目茖W支撐。未來,華大基因?qū)楦嗫蒲袌F隊提供時空組學等多專業(yè)基因測序技術與服務,破解物種培育密碼,助力多領域物種育種。

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